合肥注册农民合作社的流程和资料如下：

1. 登记申请书：农民合作社的法人资格是指由其本身享有的权利和承担的义务，注册需要提交登记申请书。

2. 登记管理机关：根据规定，农民合作社应当向其所在地县级以上行政区划的农业行政主管部门提出登记申请。

3. 提交申请材料：申请人应向农业行政主管部门提交申请书、章程、会员名册、住所使用证明、设立会议决议等资料。

4. 签署合同：农民合作社应与其成员签署合同，明确各自的权利和义务。同时，需全体设立人签名、盖章的设立大会纪要、全体设立人签名、盖章的章程等。

5. 缴纳注册资金：申请注册的合作社必须按规定缴纳注册资金，并将其存入指定的银行账户中。

6. 完成审批手续：申请人应当提交所有必要的文件后接受审批，并在通过审批后领取营业执照。

7. 纳税登记：申请人还需要按规定进行纳税登记，向税务机关申请税务登记证，并按时缴纳税款。

8. 完成其他手续：申请人还需要完成其他必要的手续，包括社会保险、其他需要办理的许可等。

9. 免费咨询农民合作社注册相关问题。