合肥市食品经营许可证网上申报流程如下：

一，登录安徽省食品药品监督管理局网站（http://wz.anhuinews.com:8080/hfgsyyj/），进入“企业办事”页面。

二，在“企业办事”页面中选择“食品经营许可证”，点击“申请材料”按钮，下载并填写《食品经营许可申请表》。

三，根据《安徽省食品药品监管局关于食品经营许可申请材料的规定》，准备好所需的其他申请材料，包括《营业执照》、申请人的身份证证件等。

四，将填好的《食品经营许可申请表》和其他申请材料扫描成电子版。

五，在“企业办事”页面中选择“食品经营许可证网上申报系统”（http://www.hf12345.org），点击“立即申请”按钮。

六，按照页面提示，填写企业基本信息和所需材料信息，并上传扫描后的电子版申请材料。

七，提交申请并等待审批。在网上申报系统中，可以随时查询申请进展情况。

八，审批通过后，到“企业办事”页面中选择“食品经营许可证”，点击“申请结果查询”按钮，然后到申请的工商所打印《食品经营许可证》。

九，以上就是合肥市食品经营许可证网上申报流程。需要注意的是，申请材料和流程可能会因地区不同而有所不同，具体以当地相关政策规定为准。